A partir del año 2005 se empezó a elaborar un Proyecto de Reformulación de la Carrera de Ingeniería Electrónica en Ingeniera Civil Electrónica, compromiso a su vez adquirido en el proyecto MECESUP AUS 0301 “Mejoramiento de la calidad en la formación de Ingenieros implementando currículos basados en competencias”, desarrollado en la Facultad de Ciencias de la Ingeniería de la UACh.
En cuanto a la Carrera de Ingeniería Electrónica esta se impartía en la Facultad desde el año 1995, la que tenía un Plan de Estudios de diez semestres de duración y cuyo perfil profesional se quería optimizar en las ciencias de la ingeniería y también en el área de gestión. Para esa fecha existían once universidades que ofrecían la carrera de Ingeniería Civil Electrónica, o Civil en Electricidad con mención en Electrónica, con diversas orientaciones formativas. Por otra parte la carrera de Ingeniería Civil Electrónica que se propuso en ese tiempo atendería la demanda de una amplia región territorial y sería la única que estaría presente en el nivel de Ingeniería Civil Electrónica.
Para el 2005 la Universidad Austral de Chile aprueba el proyecto de una Escuela de Ingeniería Civil Electrónica aprovechando inicialmente la infraestructura y el recurso humano existente de la Escuela de Ingeniería Electrónica y en el Instituto de Electricidad y Electrónica. El plan de estudios de 11 semestres fue estructurado en base a la definición de un perfil de egreso fundado en competencias a desarrollar.
En 2006 se inician las actividades docentes con 51estudiantes matriculados en primer año. A la cabeza de la dirección de Escuela estaba el ingeniero Sr. Raúl Urra Ríos, académico de amplia experiencia en docencia universitaria.
Posteriormente la Facultad se adjudica el Proyecto MECESUP AUS 0701 “Perfeccionamiento en aprendizaje basado en problemas (PBL) para el cuerpo académico involucrado en la reforma curricular en base a competencias de las carreras de la FCI, implementando un plan piloto en Ingeniería Civil Mecánica e Ingeniería Civil Electrónica” en la cual académicos de la Facultad y todos los responsables de asignaturas de la Carrera recibieron la certificación de la Universidad de Sherbrook-Canadá que los acreditaba como académicos con competencias necesarias para implementar metodologías innovadoras de aprendizajes en sus programas curriculares.
En diciembre del 2010 se produce el primer egresado de la carrera de Ingeniería Civil Electrónica, el estudiante Carlos Ariel Casanova Toledo, obteniendo su Título Profesional el 19 de agosto- 2011, convirtiéndose en el primer titulado de la Carrera.
Al año siguiente en el mes de abril, asume la dirección de Escuela el ingeniero Sr. Franklin Castro Rojas (01 de Abril 2012). Durante este último lapso de tiempo se ha continuado el proceso de mejora, tanto de la Carrera como del instituto de Electricidad y Electrónica que aporta mayor número de docentes, el cual ha contratado diversos doctores, como así también el perfeccionamientode su planta docente.
En abril de este año se produjo un cambio en la Dirección de Escuela, asumiendo en este cargo el Sr. Néstor Fierro Morineaud. Durante el año 2014 se elaboraron nuevos reglamentos de Titulación, de Práctica Profesional, de Gira de Estudios y de Convalidación de Asignaturas, además se creó el programa de vinculación pre con postgrado de la Carrera con el Magíster en Ingeniería para la Innovación. Recientemente comenzó el proceso de Autoevaluación para optar por primera vez a una Acreditación Nacional y a la par se está trabajando en la Reformulación Curricular de la carrera.